(目前地球上已发现的鸟类大约有1万种，对这些鸟类进行科学地命名，遵循的是国际动物命名法规标准。
鸟类分类的基本单元是种，种下阶元为亚种。
鸟类的科学命名法
地球现存的鸟类约1万种，它们是如何命名的？
种的命名规范
种的命名方法使用双名法，即：
种的学名 = 属名（首字母大写，斜体）+ 种加词（斜体）
种加词用来修饰属名，表示为该属内的某一特定物种。
例如家麻雀的学名是Passer domesticus，其中Passer 为鹊属的学名， domesticus 为种加词。
种加词是由物种命名者命名的拉丁词，起到与属内其它物种区分的作用。常使用物种的特征描述、发现地、原产地、甚至是发现人的名字进行拉丁化后的词语作为种加词。家麻雀使用domesticus作为种加词，表现的是它们与人类的密切关系。
家麻雀，Passer domesticus
在一些特殊情况下，鸟类的种加词也有可能与属名一致。譬如喜鹊的学名是Pica pica。Pica一词在拉丁语里就是“鹊”的意思。
喜鹊，Pica pica
加州神鹫（Gymnogyps californianus）是一种濒危的大型鸟类，在加州神鹫的学名中，属名来源于希腊语，gymno表示裸体；gyps指兀鹫，而英文中的Condor源自美式西班牙语cuntur，是这种鸟类在当地的名字。
加州神鹫，Gymnogyps californianus
美洲凤头山雀（Baeolophus bicolor）全身呈灰色，胸腹部颜色较浅，背部与头顶颜色则较深，有着鲜明的双拼色拼特点。种加词bicolor在拉丁语中的意思是“有着两种颜色”，描述的正是这一特点。
美洲凤头山雀，Baeolophus bicolor
需要注意的是，如果是讨论分类学的著述，种加词的后面还要附以命名人的姓氏和发表年份，用正体书写。例如黑枕黄鹂的学名是Oriolus chinensis Linnaeus, 1766，在这个学名中，命名人林奈的姓氏不用斜体字，首字母大写，1766代表该物种于1766年被命名。如果一个种的属名接受过修订，那么则将原命名人的姓氏加以括弧，如 Cardinalis cardinalis (Linnaeus, 1758)。
北美红雀，Cardinalis cardinalis
亚种的命名规范
亚种为鸟类的种下分类阶元，常见于同一种鸟因生活地域或习性不同，从而进化出具有不同特征的群体，在动物物分类法中将其归为亚种单位。
亚种的命名方法使用三名法，即
亚种的学名 = 属名（首字母大写，斜体）+ 种加词（斜体）+ 亚种名（斜体)
前两部分为种名，亚种名用来修饰种名，表示该种的某个特定亚种。
当某一物种在发现亚种并命名时，最早发现的原种所描述的那类群体会被继续保留作为指名亚种，也叫原名亚种。在指名亚种的学名中，亚种名与种加词相同。
如白鹡鸰（Motacilla alba）在eBird网站记录共有10个亚种，包括：
- 1. 白鹡鸰指名亚种（Motacilla alba alba），指名亚种也可缩写为Motacilla a. alba。颏部与喉部呈黑色；上背部呈灰色。
- 2. 白鹡鸰英国亚种（Motacilla alba yarrelli）与Motacilla a. alba 相似，上背部呈黑色。
- 3. 白鹡鸰摩洛哥亚种（Motacilla alba subpersonata）与Motacilla a. alba 相似，颈部四周大部分为黑色，脸部带有一条黑色眼线。
- 4. 白鹡鸰灰背眼纹亚种（Motacilla alba ocularis）与Motacilla a. alba 相似，脸部带有一条黑色眼线。
白鹡鸰指名亚种，Motacilla alba alba
缩写特殊表示方法
在发表的著作物中首次提及的学名，各组成部分都会完整保留，随后在一个二名法或三名法名称中的已经提及过的部分可使用缩写，此缩写必须清楚易辨，并且一定要随加一个终止符号（句点），以避免被当作一个完整单词。例如文章中已出现Cardinalis cardinalis (Linnaeus, 1758)，那么该物种的指名亚种则可以用C. c. cardinalis (Linnaeus，1758)来表示。